La batalla ha terminado, Yami Bakura y Zorc han sido derrotados. Sin embargo, Atem, que ha recuperado sus recuerdos, todavía tiene una prueba más que enfrentar. Para que su alma vuelva al mundo de los espíritus, Atem deberá sellar los Artículos Milenarios en la lápida sagrada para que nadie vuelva a usarlos y debe enfrentarse a un poderoso adversario en Duelo y ser derrotado.
Mientras que Joey y Kaiba discuten por quién será el que enfrente al faraón, Téa sufre internamente por el futuro deYami. Por su parte, Yugi es quien finalmente decide quién será el adversario final del faraón...